У своїх ранніх роботах він розглядає модель твердої ціни на хліб, модель непрямого цінового впливу, а також змішаний метод ціноутворення, заснований на поєднанні твердого базису ціни з прогнозами її можливих змін. Він ставить питання про межі державного втручання на ринку.
Кондратьєв впритул підійшов до концепції змішаних форм впливу на економіку - з боку держави, торговельно-підприємницьк>их структур, місцевих органів влади, окремих селянських господарств. Він висував вимогу ринкової перевірки методів державної політики. Кондратьєв виходив з необхідності поєднання на базі непу планових і ринкових начал, висунув ідею тісному зв’язку і рівноваги аграрного та індустріального секторів економіки. Ефективний аграрний сектор, - вважав він, - здатний забезпечити піднесення всієї економіки, стати гарантією стійкості всього народного господарства. Кондратьев вважав необхідною першочергову допомогу господарствам, що наближається до фермерського типу, здатним забезпечити швидке нарощування виробництва товарного хліба. Його програма орієнтувалася на підтримку міцних сімейних трудових господарств, здатних стати основою економічного піднесення в країні.
Більшу частину десятиліття 1920-х років Кондратьєв працював над проблемами народногосподарського планування, становив перші плани, ставив задачу створення макроекономічної теорії планування та прогнозування. У вирішенні питань кон’юнктурних дослідженні (динаміка цін, індекси обсягів виробництва в промисловості, сільському господарстві і т.д.). Кондратьєв, будучи директором кон’юнктурного інституту при Наркомфіні СРСР, стояв на передових рубежах світової науки.
Кондратьєв вивчав об’єктивні характеристики і тенденції ринкової економіки. Він розглядав ринок як сполучна ланка між націоналізованим кооперативним і приватним секторами, а також як важливе джерело господарської інформації. Значення плану вчений бачив у забезпеченні більш швидкого, ніж при спонтанному розвитку, темпу зростання продуктивних сил, а також збалансованого зростання виробництва. Поєднання ринкових і планових почав Кондратьев вважав що застосовується в усій економіці. Однак зазначену концепцію він модифікував залежно від сектора. У сільському господарстві повинні були переважати непрямі методи впливу на ринок, у націоналізованої промисловості - прямі.
Велику роль в реальності планування Кондратьєв надавав економічних прогнозів.
Заслуга вченого у розробці стрункої концепції наукового планування, свідомого впливу на економіку при збереженні механізмів ринкового регулювання. Вже в кінці 20-х років Кондратьєв підійшов до концепції індикативного планування, реалізованої на Заході після другої світової війни.
Світовий науці Кондратьєв відомий насамперед як автор теорії великих циклів господарської кон’юнктури ( “Світове господарство та його кон’юнктури під час і після війни” - 1922, “Великі цикли економічної кон’юнктури” - 1925). Він розвинув ідею множинності циклів, виділивши різні моделі циклічних коливань сезонні (тривалість - менше року), короткі (тривалість - 3-3,5 року), торгово-промислові (середні - 7-11 років) і великі (48-55 років) .
Він вивчав статистичні дані з Англії, Німеччини, США (динаміку цін, проценту на капітал, заробітної плати, обсягу зовнішньої торгівлі, виробництва основних видів промислової продукції). Період спостережень і аналізу складав максимально 140 років. На цей відрізок часу довелося 2,5 закінчилися великих цикли .* Кондратьєв багато в чому передбачив “Велику депресію” 30-х років.
Це виражається у змінах техніки, у залученні у світові економічні зв’язки нових країн, у зміні видобутку золота і грошового обігу “.* Головну роль відіграють тут науково-технічні новації (винаходи в текстильній промисловості і виробництві чавуну, будівництво залізниць, морського транспорту, масове впровадження електрики, радіо, телефону та інші нововведення).
Тривалі кон’юнктурні коливання, вважав Кондратьєв, супроводжують емпіричні закономірності: а) на періоди підвищувальній хвилі кожного великого циклу припадає найбільша кількість соціальних потрясінь (воєн і революцій); б) періоди понижувальній хвилі кожного великого циклу супроводжуються тривалою депресією сільського господарства; в) в період підвищувальній хвилі кожного великого циклу середні капіталістичні цикли характеризуються стислістю депресій та інтенсивністю підйомів, в період понижувальній хвилі великих циклів спостерігається протилежна картина.
В останні роки життя Кондратьєв мав намір створити фундаментальну працю з проблем економічного розвитку (рівновага і зростання, статика і динаміка, цикл і кризу) в п’яти томах.